Тойота Версо может оснащаться либо бесступенчатым вариатором (CVT), либо автоматической коробкой передач (АКПП):
* Вариатор (CVT): Доступен в Toyota Verso с бензиновым двигателем 1,6 л и 1,8 л. CVT обеспечивает плавное и бесступенчатое переключение передач, что приводит к лучшей экономии топлива.
* АКПП (автоматическая коробка передач): Доступна в Toyota Verso с дизельным двигателем 2,0 л и 2,2 л. АКПП предлагает фиксированный набор передач, что обеспечивает более спортивную и отзывчивую езду.